¡Scooby Doo y Krypto al rescate!

 Con la misteriosa desaparición de la Liga de la Justicia, Lois Lane y Jimmy Olsen investigan el Salón de la Justicia, pero rápidamente son perseguidos por un fantasma, lo que los lleva a llamar a Mystery Inc. para pedir ayuda. De camino a Metrópolis, la pandilla descubre que la ciudad está invadida por villanos como resultado de la desaparición de la Liga de la Justicia. Apenas escapando al Daily Planet, se encuentran con Lois y Jimmy (quien proclama que Daphne es su novia, a pesar de sus protestas) y les explican la situación fantasma. Al recorrer el Salón de la Justicia, también conocen a Lex Luthor, Mercy Graves y al perro de Luthor, Rex.

De repente, el fantasma aparece y amenaza a la pandilla, solo para ser rechazado por un misterioso perro con superpoderes, que inicia un bloqueo sobre la pandilla para que el fantasma no pueda escapar. Atrapado adentro con Luthor y sus asociados, le presenta al perro a la pandilla como Krypto, el perro mascota de Superman que rápidamente se hace amigo de Scooby-Doo. Continuando con su investigación, la pandilla descubre que hay más fantasmas en el Salón de la Justicia. Mientras Shaggy, Scooby y Krypto asaltan la cocina, que también sirve como holocubierta, los dos primeros invocan accidentalmente hologramas de la Legion of Doom, lo que hace que el panel de control no funcione correctamente. Shaggy y Scooby distraen los hologramas el tiempo suficiente para que Krypto los apague, solo para que los tres se enteren de que Solomon Grundy se ha infiltrado en el edificio, instigando una larga persecución contra la pandilla.